因此,首先将287个成分靶点与199个疾病靶点进行关联,筛选得到42个重叠的靶点,即为YXST治疗冠心病的直接作用靶点,结果见图2。
紫外-可见分光光度计,日本岛津仪器有限公司。RGD是一种靶向分子,可特异性识别琢淄茁3整合素受体,因此,增加靶向分子为纳米载药体系提供了指引的作用,使纳米载药体系与肿瘤细胞特异性结合从而提高治疗效果。
将得到的均相溶液置于100mL内衬为聚四氟乙烯的不锈钢反应釜中,在200℃烘箱中反应10h。反应结束后,冷却至室温,在12500r/min下离心20min,弃去上清液,重复清洗4次,最后用去离子水分散,超声处理8h,4500r/min离心10min后,取上清液,除去底部大尺寸的二硫化钼,将得到的上清液用透析袋(8000~14000Da)除杂,即可得到二硫化钼纳米片分散液。为了验证DOX是通过共价连接MPRS,采用紫外-可见分光光度计检测MPRS、DOX、MPRS-DOX在800~200nm波长范围内的紫外-可见光谱。ZetasizerNanoZS纳米粒度电位仪,英国马尔文仪器有限公司。1.2 方法1.2.1 MoS2的制备MoS2纳米片的制备参考文献中的制备方法,将2.336g钼酸铵四水和5.057g硫脲溶解在70mL的去离子水中,并用超声助溶形成均相溶液。
本文设计了一种靶向MoS2纳米载药体系,以MoS2纳米片为基底,硫辛酸聚乙二醇羧酸(LA-PEG-COOH)为接枝连接靶向分子RGD,之后连接上SPDP,得到MoS2-PEG-RGDSPDP(MPRS)纳米载体。二硫化钼不仅具有较大的比表面积,而且其组成元素Mo是细胞中几种酶的必需微量元素,S是一种常见的生物元素。我国内蒙古、广东、贵州、江西、浙江、云南、吉林、甘肃、福建等地均有马铃薯粉痂病的发生,国外许多国家和地区,如以色列、美国、巴基斯坦、哥斯达黎加、韩国、意大利等均有报道。
马铃薯粉痂病(Potato powdery scab)是由粉痂菌(Spongospora subterranea f. sp.subterrane)引起的真菌性病害,主要危害根部和块茎,也可使茎染病。马铃薯粉痂病能使马铃薯产量减少10%~20%,重者可达到 50%。粉痂菌以休眠孢子囊球随种薯或病残体越冬。1 材料与方法1.1 供试菌株试验所用的粉痂菌(S. subterranea)、灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)、葫芦科刺盘孢菌(Colletotrichum lagenarium)、尖孢镰孢菌(Fusarium oxysporum)、大丽轮枝菌(Verticilliumdahliae)、核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)、茄匍柄霉菌(Stemphylium solani)、疫霉菌(Phytophthora infestans)、多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)、细极链格孢菌(Alternariatenuissima)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)、疮痂链霉菌(Streptomyces scabies)均由中国农业科学院蔬菜花卉研究所分离保存(表 1)。
和一对实时荧光定量 PCR 的特异性引物 QF: 5'-GCAACTAAATAAAATTTAATGCTAAAAGTG-3',QR:5'-TTTGTACGCTAAGTTCGATAGGAG-3',扩增产物大小为 104 bp(图 1)。近年来,由于 PCR 技术更加快速、准确、便捷而被广泛应用于病原菌的检测和定量研究。
Graff 等根据马铃薯粉痂菌内部转录间隔区设计了一对大小为 61 bp 的特异性引物 SsTQF1/SsTQR1 和一个荧光 Taqman探针 SsTQP1,可以检测和定量悬浮在水中或与粘土混合的休眠孢子堆。由于粉痂菌不能人工培养,国内对马铃薯粉痂菌检测的研究较少,其防治药剂效果也较差,因此,针对马铃薯粉痂菌,亟需建立快速、灵敏、准确性高的检测方法,为该病害的早期监测和预防提供重要依据。已报道的土壤带菌量的检测方法有诱饵法、ELISA 法和 PCR 检测。Nian 等通过建立实时荧光定量 PCR 体系从而快速准确鉴定了小麦黑穗菌(Tilletia controversa Khn),应用于小麦矮腥黑穗病的早期诊断。
混有休眠孢子囊的菌土和田间土壤总 DNA 提取采用 TIANamp Soil DNA Kit 土壤基因组 DNA 提取试剂盒提取土壤总 DNA。Hui 等以番茄幼苗作为诱饵,检测到马铃薯重茬 0~10 cm 土壤中的马铃薯粉痂病菌。Guo 等[21]通过筛选不同疮痂菌的通用探针,建立了马铃薯疮痂菌的快速 PCR 检测方法,实现了对病组织和土壤样品的快速检测。本研究通过筛选特异性好、稳定性高的粉痂菌特异性引物,建立马铃薯粉痂病快速检测体系,以期为马铃薯粉痂病的早期预警提供技术支持。
1.2 DNA 提取马铃薯粉痂病斑或培养基平板上培养一周的菌丝体,采用植物基因组 DNA 提取试剂盒提取植物基因组或病原菌基因组 DNA。针对在生产中马铃薯粉痂病危害严重,缺乏病原菌快速检测的方法的情况。
病薯和土壤中病残体为病害的初侵染源,远距离传播主要依靠种薯,田间传播主要通过浇水、病土、病肥等。NanoDrop 2000定量 DNA 浓度,保存于-20℃备用。
但是番茄幼苗诱饵法只能检测到土壤中粉痂病菌活的游动孢子,无法检测到休眠孢子且检测时间较长、操作繁琐。1.3 引物设计根据 NCBI GenBank 中已登记的马铃薯粉痂菌及其他非靶标菌的标准菌株基因序列(表2),利用DNAMAN 8.0 软件比对,选取粉痂菌内部转录间隔区和线粒体 DNA 的保守区域,设计了两对应用于普通 PCR 的特异性引物 A5: 5'-ACAACTCTTAACAGTGG-3',A9: 5'-AATGGTTAGAGACGAATC-3',C3: 5'-AATCTAGAGCACCCCGTTTTCATTCG-3',C8: 5'-TGCGCAAACCTTAATACGGGAA-3',扩增产物大小分别为 281 和 391bp。鉴于目前缺乏对马铃薯粉痂菌快速、准确的检测方法,本研究基于马铃薯粉痂菌内部转录间隔区和线粒体 DNA,分别设计了适用于初步检测的普通PCR 特异性引物和实时荧光定量 PCR 特异性引物,建立了快速、高灵敏性的检测体系。Qu 等[24]根据马铃薯粉痂菌内部转录设计了大小为 434 bp SSF/SSR 引物,该研究成功地应用于有无粉痂病症状的带菌马铃薯块茎的检测,可以检测到1/g土的孢子球。Liu 等利用棉花黄萎病的病原菌菌丝蛋白作为抗原,制备该病原菌菌丝蛋白的多克隆抗体,建立特异性检测棉花黄萎病菌的间接 ELISA 方法,但由于真菌结构与物质组成复杂,寻找特异性抗原有很大难度。引物均由北京博迈德基因公司合成
2.3 标准曲线的建立以不同稀释浓度的质粒DNA为模板,利用引物 QF/QR 进行荧光定量 PCR 扩增,结果表明,荧光 PCR 熔解峰单峰,标准曲线为 y=-3.8939x+35.228,R2=0.9966,该体系线性关系良好(图 5)。声明:本文所用图片、文字来源《植物病理学报》,版权归原作者所有。
挑取阳性克隆,转入含有氨苄青霉素的 LB 液体培养基中,37℃、180 rmin-1振荡培养12 h后,提取重组质粒并进行PCR扩增,扩增产物送至北京博迈德生物公司测序,验证是否正确插入目的片段。吸取菌液均匀涂布在含有氨苄青霉素的 LB固体平板上,37℃培养 24 h。
1.7 标准曲线建立将阳性重组质粒 DNA 进行 10 倍梯度稀释,使用引物 QF/QR 进行荧光定量 PCR 扩增。扩增条件为 94 ℃预变性5min,94 ℃变性45s,55℃退火30s,72 ℃延伸45 ,35个循环。
标准曲线的横坐标和纵坐标分别设定为质粒浓度对数值和循环阈值,使用 Excel 2010 软件构建马铃薯粉痂菌荧光定量 PCR 标准曲线。1.4 引物特异性检测引物 A5/A9、C3/C8 对马铃薯粉痂菌基因组DNA及其他 11 个非靶标菌株基因组 DNA进行普通 PCR。质粒拷贝数=[质粒浓度(ngL-1)质粒体积(L)6.021023]/[(载体长度 bp+片段长度 bp)660 gmol-1]1.6 灵敏度检测使用NanoDrop 2000 紫外分光光度计,测定马铃薯粉痂病菌质粒 DNA 浓度,再以 10倍梯度稀释,分别进行普通 PCR 和实时荧光定量 PCR 扩增,根据有无扩增条带及荧光信号值大小,检测其灵敏度。1.5 重组质粒的制备马铃薯粉痂菌特异性引物 QF/QR 的扩增产物经回收纯化后,与 pEASY-T1 载体于 25℃连接,转入大肠杆菌 Trans1-T1 感受态细胞中。
应用引物 QF/QR 进行实时荧光定量 PCR 扩增,结果表明该引物仅对马铃薯粉痂病菌有唯一的产物吸收峰(图 3)。1.8 田间土壤及罹病块茎组织样品检测及验证分别从云南省邵通市、甘肃省定西市和河北省张家口市采集 18份带菌土壤和18 份带菌种薯样品,按照 1.2 中的方法提取植物组织样品总 DNA,进行普通 PCR 和荧光 PCR 检测,计算检出率。
用测定质粒 DNA 浓度和纯度,根据摩尔定律,计算单位体积质粒所含的 DNA 拷贝数浓度。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系相关链接:土壤,马铃薯,DNA。
荧光 PCR 反应体系(20 L)为:2SuperReal PreMix Plus 10L,上下游引物(0.1 molL-1)各 0.5 L,50ROXReference Dye 0.4 L,模板 DNA(10 ngL-1)0.5 L,ddH2O 8.1 L。普通 PCR 反应体系(50L)为:2Taq PCR Master Mix 25 L,上下游引物(0.1 molL-1)各 0.5L,模板 DNA(10 ngL-1)0.5 L,ddH2O 23.5 L。
荧光 PCR 反应条件为 95℃预变性 15 min,95℃变性 10 s,60℃退火 32 s,40 个循环。引物 QF/QR 对马铃薯粉痂菌基因组 DNA 及其他 11 个非靶标菌株基因组DNA 进行荧光 PCR,ddH2O 作为阴性对照,检测引物的特异性。2.2 灵敏度检测利用引物 QF/QR 对不同浓度质粒 DNA 进行常规 PCR 和荧光定量 PCR 扩增,结果表明常规 PCR 灵敏度为 1.38104 fgL-1,荧光定量 PCR 灵敏度为 13.8 fgL-1,是常规 PCR检测灵敏度的 1000 倍(图 4)。2 结果与分析2.1 引物特异性验证应用引物 A5/A9 和 C3/C8 对马铃薯粉痂病菌和其它 11 株非靶标病原真菌基因组 DNA进行常规 PCR 扩增,结果显示仅马铃薯粉痂病菌 DNA 扩增出 281 和 391 bp 的目的条带,而其它供试菌株 DNA 和清水对照未扩增出条带(图 2)
当土壤含量进一步增加到降低土壤透气性时,植物蒸腾强度会因为植物根系活性的下降而减弱。表明当光照强度大于1000mol/(m2s)时,植物为减少伤害,气孔被迫关闭,降低了青海云杉的蒸腾作用。
土壤含水量为14.53%时,青海云杉的水分利用效率最大。青海云杉的回归曲线的相关系数平方R2大于0.8,表明土壤水分含量与净光合速率之间有很高的相关性,曲线拟合程度很高。
植物只有在适宜的水分条件和合理的光照范围内,才能更好的生长发育。暗中叶片不进行光合作用,只有呼吸作用释放CO2。
不过,陈文静认为,今年以来,热点城市市场恢复节奏更快,全国市场整体预期仍较弱,住户中长期贷款整体仍处在修复阶段,未来若政策端持续发力、宏观经济稳步向好,购房者置业信心有望继续好转,从而带动全国房地产市 [阅读]
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